Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APIPQ96GX9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APIPQ96GX9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APIPQ96GX9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APIPQ96GX9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms