Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX27Q96GQ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX27Q96GQ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DDX27Q96GQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms