Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LTV1Q96GA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
LTV1Q96GA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LTV1Q96GA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LTV1Q96GA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LTV1Q96GA3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms