Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BICD1Q96G01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BICD1Q96G01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BICD1Q96G01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
BICD1Q96G01 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BICD1Q96G01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms