Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STAMBPL1Q96FJ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STAMBPL1Q96FJ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STAMBPL1Q96FJ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms