Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNRIP1Q96F85 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNRIP1Q96F85 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNRIP1Q96F85 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNRIP1Q96F85 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNRIP1Q96F85 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms