Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NMD3Q96D46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMD3Q96D46 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NMD3Q96D46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms