Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GCC1Q96CN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GCC1Q96CN9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCC1Q96CN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms