Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTHRC1Q96CG8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTHRC1Q96CG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTHRC1Q96CG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTHRC1Q96CG8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTHRC1Q96CG8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms