Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ULK4Q96C45 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK4Q96C45 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ULK4Q96C45 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ULK4Q96C45 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ULK4Q96C45 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms