Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EME1Q96AY2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EME1Q96AY2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms