Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FUBP1Q96AE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FUBP1Q96AE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FUBP1Q96AE4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms