Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM52Q96A61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TRIM52Q96A61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TRIM52Q96A61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TRIM52Q96A61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms