Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2E3Q969T4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2E3Q969T4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2E3Q969T4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2E3Q969T4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms