Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM54Q969K7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM54Q969K7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM54Q969K7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms