Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFKQ969G6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFKQ969G6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFKQ969G6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms