Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C6Q969F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GTF3C6Q969F1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C6Q969F1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C6Q969F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms