Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMM1Q92871 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMM1Q92871 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMM1Q92871 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMM1Q92871 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMM1Q92871 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMM1Q92871 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMM1Q92871 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMM1Q92871 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms