Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTAQ92696 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RABGGTAQ92696 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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RABGGTAQ92696 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RABGGTAQ92696 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RABGGTAQ92696 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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