Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A6Q92581 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A6Q92581 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A6Q92581 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms