Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN4Q92575 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN4Q92575 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBXN4Q92575 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN4Q92575 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms