Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2BQ8WXI9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATAD2BQ8WXI9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GATAD2BQ8WXI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GATAD2BQ8WXI9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms