Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG3Q8WXD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG3Q8WXD2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCG3Q8WXD2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms