Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC107Q8WV48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC107Q8WV48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC107Q8WV48 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC107Q8WV48 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms