Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
DDX54Q8TDD1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DDX54Q8TDD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DDX54Q8TDD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DDX54Q8TDD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DDX54Q8TDD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms