Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCD1

C18orf32, UPF0729 protein C18orf32, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf32Q8TCD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C18orf32Q8TCD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C18orf32Q8TCD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C18orf32Q8TCD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C18orf32Q8TCD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms