Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBA3Q8TBC4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBA3Q8TBC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBA3Q8TBC4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBA3Q8TBC4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms