Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMO3Q8TAP4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO3Q8TAP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO3Q8TAP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms