Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDV1

ST6GALNAC3, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST6GALNAC3Q8NDV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ST6GALNAC3Q8NDV1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms