Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARRDC4Q8NCT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARRDC4Q8NCT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARRDC4Q8NCT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms