Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM35BQ8NCS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM35BQ8NCS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM35BQ8NCS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM35BQ8NCS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.8 ms