Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBBP8NLQ8NC74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBBP8NLQ8NC74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBBP8NLQ8NC74 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBBP8NLQ8NC74 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms