Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM1BQ8NB78 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM1BQ8NB78 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM1BQ8NB78 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms