Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L2Q8NAA4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG16L2Q8NAA4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG16L2Q8NAA4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG16L2Q8NAA4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms