Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNLDC1Q8NA58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNLDC1Q8NA58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNLDC1Q8NA58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms