Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC29Q8NA56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTC29Q8NA56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTC29Q8NA56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC29Q8NA56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms