Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNYL1Q8N7R7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNYL1Q8N7R7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNYL1Q8N7R7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNYL1Q8N7R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms