Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO5AQ8N6Q1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO5AQ8N6Q1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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