Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LNX2Q8N448 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNX2Q8N448 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNX2Q8N448 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms