Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2Q8IXS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2Q8IXS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2Q8IXS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2Q8IXS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2Q8IXS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM2Q8IXS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PALM2Q8IXS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PALM2Q8IXS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2Q8IXS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms