Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM48Q8IWZ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM48Q8IWZ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM48Q8IWZ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM48Q8IWZ4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms