Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APLFQ8IW19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APLFQ8IW19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APLFQ8IW19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLFQ8IW19 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms