Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
APOBEC3FQ8IUX4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
APOBEC3FQ8IUX4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms