Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDSS2Q86YH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDSS2Q86YH6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS2Q86YH6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS2Q86YH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms