Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NPM2Q86SE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NPM2Q86SE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NPM2Q86SE8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NPM2Q86SE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
NPM2Q86SE8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NPM2Q86SE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NPM2Q86SE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPM2Q86SE8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NPM2Q86SE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NPM2Q86SE8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms