Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNKQ7Z7G1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLNKQ7Z7G1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLNKQ7Z7G1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLNKQ7Z7G1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms