Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETXQ7Z333 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SETXQ7Z333 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SETXQ7Z333 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SETXQ7Z333 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 943.7 ms