Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GDPD3Q7L5L3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GDPD3Q7L5L3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms