Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
XIRP1Q702N8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
XIRP1Q702N8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
XIRP1Q702N8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
XIRP1Q702N8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
XIRP1Q702N8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
XIRP1Q702N8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms