Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXIP1Q6ZW49 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PAXIP1Q6ZW49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXIP1Q6ZW49 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAXIP1Q6ZW49 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms